Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HLA-DQB1P01920 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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