Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIN3BO75182 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms