Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ZNF208O43345 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms