Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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