Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
C9orf92A6NGG3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms