Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9Y3F1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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