Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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