Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DNMT3BQ9UBC3 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms