Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IFNKQ9P0W0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms