Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCC13Q9NSE7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms