Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CYP4F12Q9HCS2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms