Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
USP29Q9HBJ7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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