Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
BHLHE41Q9C0J9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
BHLHE41Q9C0J9 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms