Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM4Q9C037 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms