Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms