Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM55Q9BYV6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms