Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 REST-205ENST00000611211 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353608.4-201ENST00000624487 1188 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R3C-213ENST00000555644 1347 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMC2-206ENST00000640277 1357 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMMSON-206ENST00000641053 1516 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms