Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF17Q9BXT8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms