Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms