Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHOXF2Q9BQY4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms