Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LPIN3Q9BQK8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LPIN3Q9BQK8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms