Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP88Q99567 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms