Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms