Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TSPAN18Q96SJ8 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms