Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRD1AQ96P16 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms