Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC7Q96M83 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms