Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COG3Q96JB2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms