Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms