Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C18orf8Q96DM3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms