Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms