Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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