Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN19Q8N6F1 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN19Q8N6F1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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