Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNE4Q8N205 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms