Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms