Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ANKRD54Q6NXT1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms