Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RTL6Q6ICC9 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTL6Q6ICC9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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