Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GRAMD4Q6IC98 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms