Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FRMPD1Q5SYB0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms