Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
WDR44Q5JSH3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WDR44Q5JSH3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms