Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms