Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PKDCCQ504Y2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKDCCQ504Y2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms