Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms