Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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RTL8BQ17RB0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
RTL8BQ17RB0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
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