Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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DDB1Q16531 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB1Q16531 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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