Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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RPE65Q16518 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RPE65Q16518 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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