Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms