Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SYCP1Q15431 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SYCP1Q15431 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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