Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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