Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NFIXQ14938 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms