Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CHD4Q14839 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHD4Q14839 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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